此前,CRISPR/Cas介導的植物基因組定點敲除技術(shù)只能在基因組特定位點產(chǎn)生隨機插入和刪除,精準的片段插入和替換的效率一直很低,極大地限制了其在植物研究和育種上的應用。因此,迫切需要建立更高效的植物基因組片段插入和替換技術(shù)體系。
朱健康研究組通過嘗試,發(fā)現(xiàn)將供體片段同時進行硫代修飾和磷酸化修飾后,能極大地增強CRISPR/Cas9引導的靶向敲入效率。研究團隊先后在14個基因位點上成功靶向敲入了各類調(diào)控元件,包括翻譯增強子、轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件,甚至整個啟動子,供體片段最長達2049bp。通過對1393株各類T0代基因編輯水稻植株的分析發(fā)現(xiàn),該方法的敲入效率可高達47.3%,平均效率為25%。如此高的敲入效率甚至可以同時在四個位點上實現(xiàn)多基因靶向敲入。
研究人員預計,該技術(shù)的建立將使靶向敲入成為一項和靶向敲除一樣的常規(guī)實驗,被各個植物研究和育種單位廣泛應用。
同時,研究人員又巧妙地設(shè)計了一種片段精準替換的策略,稱之為重復片段介導的同源重組(TR-HDR)方法。常規(guī)的HDR頻率極其低下,但他們在前期的實驗中發(fā)現(xiàn),基因組上串聯(lián)重復片段間的HDR頻率非常高。他們利用這一現(xiàn)象,通過將修飾的片段靶向敲入目標位點,人為制造這種串聯(lián)重復結(jié)構(gòu),誘導TR-HDR去實現(xiàn)片段替換。采用該技術(shù),他們在五個基因位點上實現(xiàn)了片段替換和原位的Flag標簽蛋白的精準融合,效率最高達到了11.4%。這一技術(shù)突破將有助于植物學研究,并促進農(nóng)作物定向遺傳改良的進程。(岳陽)
中國科學報